특허 존속기간 연장 요건과 신청 절차, 한 번에 정리합니다 | 특허법인 테헤란
  • 칼럼
  • 2026.10.18

특허 존속기간 연장 요건과 신청 절차, 한 번에 정리합니다

특허 존속기간 연장 요건과 신청 절차, 한 번에 정리합니다

핵심 요약

특허 존속기간 연장이란, 의약품·농약처럼 허가·등록 절차 때문에 특허권을 실질적으로 실시하지 못한 기간만큼 존속기간을 최대 5년까지 늘려 주는 제도입니다.

신청하려면 특허 만료일 3개월 전까지 특허청에 서류를 제출해야 하며, 허가·등록 지연 기간과 '특허권 실시 불가' 사유가 명확히 연결되어야 합니다.

대상 특허가 의약품 또는 농약이라 하더라도 요건을 갖추지 못하면 연장이 거절될 수 있어, 심사기준을 사전에 꼼꼼히 확인하는 것이 중요합니다.

신약 개발에 수년을 쏟아부었는데, 정작 식품의약품안전처 허가를 받고 나니 특허 만료일이 너무 가까워진 상황 — 제약·농약 기업이라면 이 답답함이 낯설지 않을 겁니다.

특허는 출원일로부터 원칙적으로 20년이 존속합니다.

그런데 의약품이나 농약의 경우, 제품을 시장에 내놓기 전 반드시 정부 허가·등록을 받아야 합니다.

이 허가 기간이 길어지면, 특허가 살아 있음에도 제품을 팔 수 없는 공백이 생기죠.

이 불합리한 공백을 보상해 주기 위해 만들어진 것이 바로 이 제도입니다.

제도 자체는 알고 있더라도, 막상 신청 단계에서 요건이 생각보다 엄격하고 절차도 까다롭다는 것을 느끼는 분들이 많습니다.

이번 글에서는 2026년 기준으로, 인정 요건부터 신청 절차, 그리고 연장등록 심사기준에서 자주 문제가 되는 포인트까지 차례대로 살펴보겠습니다.

특허 존속기간 연장이 인정되는 요건은 무엇인가요?

연장 대상 특허: 의약품과 농약으로 한정

존속기간 연장은 모든 특허에 적용되지 않습니다.

현행법상 연장이 허용되는 특허는, 실시를 위해 '다른 법령에 따른 허가 또는 등록'이 필요한 경우로 제한됩니다.

실무적으로는 크게 두 가지가 해당됩니다.

  • 의약품 특허 연장: 「약사법」에 따른 의약품 품목 허가를 받은 경우
  • 농약 특허 연장: 「농약관리법」에 따른 농약 등록을 받은 경우

제조방법 특허, 소재 특허 등도 위 허가·등록과 직접 연결된다면 연장 대상이 될 수 있습니다.

다만 '연결된다'는 관계가 심사에서 분명히 인정되어야 하기 때문에, 이 부분을 어떻게 입증하느냐가 실질적인 관건이 됩니다.

4가지 핵심 요건을 모두 충족해야

국가법령정보센터에서 확인할 수 있는 특허법 제89조에 따르면, 연장등록을 받기 위해서는 아래 요건을 갖춰야 합니다.

요건 내용
허가·등록 필요성 특허 실시를 위해 법령상 허가 또는 등록이 필요한 특허일 것
실시 불능 기간 허가·등록 절차로 인해 특허를 실시하지 못한 기간이 존재할 것
특허권 존속 중 허가 허가·등록이 특허권 존속기간 내에 이루어졌을 것
연장 기간 상한 연장 기간이 최대 5년을 초과하지 않을 것

네 가지 요건 중 하나라도 충족하지 못하면 연장등록이 거절됩니다.

특히 '실시 불능 기간' 계산이 까다로운데, 허가 신청부터 허가 취득까지의 전 기간이 자동으로 인정되는 것이 아닙니다.

허가 당국의 처리 기간 중에서도 신청인 귀책이 없는 기간만을 기준으로 산정한다는 점을 꼭 기억해 두셔야 합니다.

특허 존속기간 연장등록 신청 절차와 기간

신청 시기: 만료 전 3개월이 기준

연장등록 신청은 타이밍이 매우 중요합니다.

원칙적으로, 특허 존속기간 만료일 3개월 전까지 특허청에 신청서를 제출해야 합니다.

이 기한을 놓치면 연장 자체를 받을 수 없게 됩니다.

반대로 허가·등록을 받은 날로부터 3개월 이내에도 신청할 수 있는데, 허가 취득 시점과 특허 만료 시점 중 빠른 기준을 함께 고려해 신청 적기를 판단해야 합니다.

2026년 기준으로 특허청 온라인 출원 시스템(특허로)을 통한 전자 신청이 가능하며, 서면 신청도 병행할 수 있습니다.

준비 서류와 제출 흐름

신청 시 제출해야 할 주요 서류는 다음과 같습니다.

  • 특허권 존속기간 연장등록 신청서
  • 허가증 또는 등록증 사본 (의약품·농약 허가 당국 발행)
  • 연장 기간 산정 근거 자료 (허가 신청일·허가 취득일을 확인할 수 있는 문서)
  • 특허 청구항과 허가 대상 물질·용도의 대응 관계를 설명하는 자료

서류 준비 과정에서 가장 많이 실수하는 부분이 '대응 관계 설명'입니다.

허가를 받은 성분·물질이 특허 청구항에 기재된 발명과 어떻게 연결되는지를 명확히 서술하지 않으면, 심사 단계에서 보정 요청이나 거절로 이어질 수 있습니다.

처음 진행하신다면, 이 단계에서 전문가 검토를 한 번 거치는 것이 시행착오를 상당히 줄여줍니다.

심사 기간과 이후 절차

특허청 심사 기간은 사건 복잡도에 따라 다르지만, 통상 수개월에서 1년 이상 소요될 수 있습니다.

심사관이 거절 이유를 통지하면 의견서 또는 보정서를 제출해 대응할 기회가 주어지고, 최종적으로 연장등록 결정이 나면 등록 공고가 이루어집니다.

연장등록이 완료되면, 연장된 기간만큼 특허권이 계속 유지됩니다.

단, 연장된 특허권의 효력은 허가·등록을 받은 대상 물질·용도에 한정된다는 점을 반드시 알아두셔야 합니다.

연장등록 심사기준, 어떤 점을 꼼꼼히 살펴볼까요?

심사에서 자주 문제가 되는 두 가지

연장등록 심사기준에서 가장 빈번하게 지적되는 것은 '연장 기간의 적정성'과 '특허와 허가 대상 간 동일성' 두 가지입니다.

먼저 연장 기간은 허가·등록 기간 전체가 아니라, 특허권자 귀책 없는 순수 심사 지연 기간으로 계산됩니다.

허가 신청을 늦게 했거나, 보완 자료 제출이 지연됐다면 그 기간은 연장 기간에서 제외될 수 있습니다.

다음으로 동일성 문제는, 허가받은 유효 성분과 특허 청구항에 기재된 화합물·조성물이 동일한지를 심사관이 판단하는 과정에서 발생합니다.

청구항이 넓게 기재되어 있을수록 이 관계를 정확히 입증하기 어려워지기 때문에, 출원 단계에서부터 연장 가능성을 염두에 두고 청구항을 설계하는 것이 이상적입니다.

여러 허가를 받은 경우와 복수 연장 이슈

하나의 특허에 대해 여러 번의 허가·등록이 이루어진 경우에도 연장은 원칙적으로 1회만 인정됩니다.

동일한 특허에 대해 복수의 연장등록을 중복 신청하는 것은 허용되지 않습니다.

단, 허가받은 물질이나 용도가 서로 다른 경우 별개의 허가로 볼 수 있는지 여부가 쟁점이 될 수 있습니다.

이처럼 경계가 불분명한 케이스는 심사 결과를 예측하기 어렵기 때문에, 사전에 심사기준을 검토하고 전략을 세우는 과정이 필요합니다.

무효 가능성과 사후 분쟁 리스크

연장등록이 완료된 이후에도 제3자가 연장등록 무효 심판을 청구할 수 있습니다.

특히 제네릭 의약품 업체가 오리지널 특허의 연장등록을 공격하는 사례가 실무에서 종종 발생하죠.

연장 기간 산정 근거와 허가-특허 대응 관계를 철저하게 기록해 두는 것이, 사후 분쟁에서 가장 중요한 방어 수단이 됩니다.

신청 단계의 서류 품질이 결국 분쟁 리스크를 낮추는 출발점이라는 점에서, 신청 단계를 가볍게 보지 않는 것이 중요합니다.

자주 묻는 질문

특허 존속기간 연장 신청 비용은 얼마나 드나요?

특허청에 납부하는 관납료는 2026년 기준으로 수십만 원 수준이며, 정확한 금액은 특허청 공식 수수료 기준을 확인하시는 것이 가장 정확합니다. 여기에 대리인 비용이 추가되는데, 사건 복잡도나 서류 분량에 따라 차이가 있으므로 사전에 견적을 받아보시길 권합니다.

의료기기 특허도 존속기간 연장이 가능한가요?

현행 특허법상 존속기간 연장 대상은 의약품과 농약에 한정되어 있으며, 의료기기는 해당하지 않습니다. 의료기기 허가에 오랜 시간이 걸렸더라도 법적 근거가 없기 때문에, 특허 포트폴리오를 설계할 때 이 점을 미리 고려하는 것이 좋습니다.

연장등록 신청은 특허권자 본인이 직접 할 수 있나요?

국내 특허권자는 원칙적으로 직접 신청이 가능합니다. 다만 허가-특허 대응 관계 서류 작성, 연장 기간 산정, 심사 대응 등 기술적·법적 판단이 필요한 과정이 포함되어 있어, 실무에서는 대부분 변리사를 통해 진행하는 사례가 많습니다.

정리하며

특허 존속기간 연장은 단순히 기간을 늘리는 행정 절차가 아닙니다.

연장 요건 충족 여부 판단, 연장 기간 산정, 심사 대응, 사후 분쟁 리스크 관리까지 이어지는 일련의 과정입니다.

핵심은 세 가지입니다. 대상 특허가 의약품 또는 농약 관련인지, 신청 타이밍(만료 전 3개월)을 지켰는지, 그리고 허가와 특허 청구항의 대응 관계를 명확히 입증할 수 있는지입니다.

특히 신청 서류의 품질은 나중에 무효 심판이나 분쟁이 생겼을 때 방어력을 결정하는 중요한 요소가 됩니다.

연장등록 심사기준이 해마다 세부적으로 업데이트되기도 하는 만큼, 신청 전에 최신 기준을 확인하고 준비 방향을 잡는 것이 안전합니다.

검토 중이시라면, 요건과 일정을 함께 짚어볼 수 있도록 전문가와 한 번 이야기해 보시길 권합니다.

상담이 필요하시다면 대표번호 1668-3452로 편하게 문의해 주세요.

Chung Yeahhyuck
정예혁
파트너변리사
학력
    한국해양대학교 해사대학 운항시스템공학부 졸업
    한국방송통신대학교 법학과 졸업
    서울대학교 글로벌 (베트남) 미래전략 최고위과정 수료
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경력
    (현)특허법인 테헤란 파트너 변리사
    한국지식재산보호원 베트남 호치민IP센터 센터장
    (주)스탤리온파트너스 부장 심사역
    고려대학교산학협력단 기술사업화센터 변리사
    특허법인 로얄
    특허법인 이지
    나우특허법률사무소
    제52회 변리사시험 합격(2015년, 디자인보호법 수석)
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